Le Championnat du Japon de football 1987-1988 est la vingtième-troisième édition de la Japan Soccer League. La saison a débuté le et s'est achevée le .
Le premier tour est constitué de deux groupes régionaux (Est et Ouest). Chaque groupe est composé de huit clubs. Les quatre premiers de chaque groupe sont qualifiés pour le groupe de promotion. Les quatre derniers de chaque groupe sont qualifiés pour le groupe de relégation de leur zone régionale.
Le premier du groupe Est rencontre le premier du groupe Ouest pour déterminer le 9e et le 10e du classement. Le second de l'Est et de l'Ouest s'affrontent pour déterminer le 11e et le 12e du classement. Les troisièmes de l'Est et de l'Ouest se disputent les 13e et 14e places. Enfin les deux derniers de chaque groupe s'affrontent pour déterminer le 15e et le 16e du classement.